2014-01-01から1年間の記事一覧

動画まとめ

aLeavesは最終確認をしてもらっているので上がりませんがもう全部できています。Arabidopsis eFP Browser でシロイヌナズナの遺伝子発現情報を見る 統合TV(togotv)|生命科学系DB・ツール使い倒し系チャンネル こっちは上がった

aLeave MAFFT 3

苦情 要請が来たので修正しました。系統樹推定についてよくわかっていなかったらしく、MAFFTサーバに渡してからの作業が結構適当だったようです。BLASTで相同性検索をして取ってきたデータを元にして作ったtreeはguide treeというようで、これは系統樹とは言…

Arabidopsis eFP Browser 2

一通り編集も終わって原型ができてしまったのですが、h_onoさんが不在だったためうpは次回になりそうです。 ということでこのブラウザの特徴を言葉で書いていこうと思います。(前回消えたやつや)・遺伝子のIDを入力することで、その遺伝子発現量を見る。 …

Arabidopsis eFP Browser 1

調査報告を書いていたのですがログアウトされて全部消えていたので面倒なので書きません。 チケットにある調査依頼はクリアしているので撮影しました。追記 動画を撮り終わって2分ほど編集しました。