収穫祭準備

今日は収穫祭のプレゼンの準備をしていました

流れはこんなかんじに
スライドはこの内容からは想像できない感じになっています

・自己紹介 *
　名前、大学、Twitterアカウント、牧場の話
　収穫祭は初めてなのでやってきたことを時系列順に紹介します

・ArrayExpress *
　大学１年からバイトを始めたので全然わかりませんでした *
　　最初は動画のアップデートから始めました
　　　ツールやDBの更新に伴いアップデートをすることもあります
　　どんな実験によるどんなデータなのか分からない
　　用語がわからない(読み間違い)
　　マイクロアレイについては原理だけ知っている状態
　　今はわかるようになりました
　わからなくても何とかなります *
　　本当にわからない部分は質問すればOK
　出勤４回くらいで一つの動画が出来上がりました

・アップデートが必要な動画の調査
　今までに作られた動画で、アップデートが必要なものを探す *
　　とりあえず動画のとおりにやってみる
　　　インターフェースが変わっているもの
　　　リンクが切れているもの
　　　動画のとおり動かしてもうまくいかないもの
　　　→リストアップ
　Curatedのミスも見つけてみる *
　　手動で編集しているので、ミスもある *
　この作業のお陰で色々なツールやDBを知ることができました

・Galaxy EMBOSSの使い方 *
　要アップデートなものの中に、EMBOSSがありました
　　配列を弄るツールの紹介動画を作りたかった
　　例：revseq
　もともとDBCLSで日本語版の（？）EMBOSSを提供していた *
　　苦情？も来ていた
　Galaxy内のツールとして移行（？）
　　→Galaxyの使い方の一部として紹介動画を作ることに
　（講習会なんかで使われているようです）
　この動画を作る過程で、バグも発見しました
　　DBCLSのバグチェックの意味も含んでいました
　４つで４ヶ月やっていました
　　配列変換・アラインメント・配列検索・ドットプロット

・他の動画も……
　MMDB
　　NCBIの他のデータベースへのリンクが多かった
　Sigma-AldrichのYour Favorite Gene
　　（リンク集とはいえ）いろいろな機能が揃っていた
　Strap
　　万能ツールだった（製作中）

　「このように、動画のアップデートから少しずつ範囲を広げていけば
　　勉強しながら万能なツールの紹介動画などを作ることもできます！」