アップデートが必要なものの調査2
進捗状況
3人でやっているのでどの辺まで終わっているかまとめておきます。
・ゲノム・核酸配列解析
終了
・タンパク質配列・構造解析
tryが手をつけ始めた。
・発現制御解析
るおりんがやってる。
・文献検索・辞書 情報収集 PC環境構築
終了
・DBCLSサービス 講演・講習動画
サービスは終了
講演とかはアップデート不能。
・データベース別分類
上のカテゴリーと内容が重複しているので保留
(※まず、Curatedと統合TVのエントリの更新(アップデートされた動画関係の更新)をしました。)
動画の途中再生がうまく行かないことがあるけどこれはパソコンのほうが悪いのか?
そして先週行ったアップデートが必要な動画の調査その2です。
・ゲノム・核酸配列解析
http://togotv-curated.dbcls.jp/contents/category/genome
配列解析パッケージEMBOSSで塩基配列を処理するの項目
http://emboss.dbcls.jp/ のページがなくなっている。
代わりに
EMBOSS Explorer
のサイトが使えそう?
URLは違うものの、英語になっているだけなので、そこまでアップデートが必要ではないかもしれない。
アップデート必要度低?
(どうしてなくなったんだろう・・・)
CLC Bio社のツールを用いるの項目
CLC Sequence Viewer
CLC Sequence Viewerを使い倒す〜導入から基本操作まで〜 統合TV(togotv)|生命科学系DB・ツール使い倒し系チャンネル
導入のページはすこしアイコンが変わっているけど見つけられると思う。
アップデート不要。
CLC Sequence Viewerを使い倒す〜配列入手から系統樹作成まで〜 統合TV(togotv)|生命科学系DB・ツール使い倒し系チャンネル
万能ソフトすげぇ!
アップデート不要。
Workbenchについて
まだ動画ができてから半年でソフトも大してバージョンアップしていないようなので飛ばしました。
http://togotv.dbcls.jp/20110725.html#p01
インターフェースが大幅に変更されている。
検索画面まで行ければあとは一緒の様子。
要アップデート?
NCBI BioProjectの使い方 統合TV(togotv)|生命科学系DB・ツール使い倒し系チャンネル
変更はない模様。
アップデートの必要はなし。
CentroidFoldを使ってRNAの2次構造を予測する 統合TV(togotv)|生命科学系DB・ツール使い倒し系チャンネル
変更はなし。
アップデート不要。
・タンパク質配列・構造解析
検索結果の画面が大幅に変わっている
アップデートが必要
次のやつは重複。(さっきやった)
「アミノ酸配列の比較や系統樹を描きたいとき」まで終わりました。
ベチャベチャvsカラカラ