DBCLS GalaxyのEMBOSS(Alignment編)の動画撮影が終了し、編集も少し進めました。 再来週辺りにあげられるといいなぁ。（早足

DBCLS Galaxy EMBOSSの使い方〜配列変換編〜 統合TV(togotv)｜生命科学系DB・ツール使い倒し系チャンネル 5週でやっと上がりました。 Galaxyの使い方になれるのに時間がかかったので次は4週以内で上がることを祈ります。そしてその「次」ですが、こんどはEMB…

動画編集終了です！ 水曜日にMOVに変換して統合TVに上げます！

EMBOSSの変換編の編集が、 revseq,prettyseq,sixpackの分は終わりました。だいぶスムーズに作れるようになったと思う。 来週は休みだから再来週にはあげられるかなぁ。

DBCLS GalaxyのEMBOSSの使い方の動画を撮り終えて編集に入りました。 今回、主な変換ツールのrevseq, prettyseq, sixpack(これは変換だけじゃないけど), backtranseqをまとめて動画にしました。（少し長くなりそうｗ 使った塩基配列は１つだけで、sixpackで…

次の仕事はDBCLS GalaxyのなかのEMBOSSを作ること。 また、バグフィックスも兼ねているのでいろいろいじれとの司令。今日はEMBOSSのツールにどういうものがあるのか、過去の動画を見て調査しました。・merger 塩基配列２つをアラインメントし、スコアを返す…

アップデートが必要ATTED-IIを使い倒す http://togotv.dbcls.jp/20090522.html#p01Spotfireを用いたマイクロアレイデータのGene Ontologyによるアノテーション http://togotv.dbcls.jp/20090808.html#p01Galaxyを使い倒す-特定の転写因子予測結合領域と遺伝…

あとは遺伝子発現制御だけです。 るおりんが適当な順番でやっているようなのでうわああぁ発現制御解析遺伝子・タンパク質発現を網羅的に調べたい Allen Brain Atlasを使い倒す 〜基本編〜 2011 統合TV(togotv)｜生命科学系DB・ツール使い倒し系チャンネル ht…

タンパク質配列・構造解析 タンパク質のモチーフやドメインを知りたいときPDBj Mineを使ってタンパク質を検索する 統合TV(togotv)｜生命科学系DB・ツール使い倒し系チャンネル ほとんど全く変わっていない。 アップデート不要万見(Yorodumi)の使い方 基本と…

進捗状況 3人でやっているのでどの辺まで終わっているかまとめておきます。 ・ゲノム・核酸配列解析 終了 ・タンパク質配列・構造解析 tryが手をつけ始めた。 ・発現制御解析 るおりんがやってる。 ・文献検索・辞書 情報収集 PC環境構築 終了 ・DBCLSサービ…

今日は動画のページ（ダイジェスト、スーパー、Youtube）を作り終えたあと、アップデートが必要な動画の調査をしていました。 動画ページは→ArrayExpressを使い倒す1 データの検索方法および生データのダウンロード方法 2012 統合TV(togotv)｜生命科学系DB・…

先週はインフルエンザにやられて仕事ができませんでした。 そして今日こそ動画の出力！からのうｐ！早く終わると思っていたのですが意外と時間がかかってしまいました。 しかし無事にアップすることができました。ArrayExpressを使い倒す1 データの検索方法…

今日は先週の続き、動画作成をしていました。 あとはロゴを入れるまで完成しました。来週は上がるでしょうﾑﾌフレームの分割部分では吹き出しをまたいで設置出来なかったのですが、2つ連続させて設置すれば繋がったように見えるようです。 新しくわかったこと…

今日はArrayExpress < EMBL-EBIの紹介動画を撮影し、編集に入りました。 検索フォーム自体はあまり変わっていないので前の動画を見ながらマイナーチェンジをしている感じです。Camtasia Studio 7の使い方ですが、ハイライトと吹き出しを同時に表示した時に吹…

今日は「Camtasia Studio 7」を使って動画を作るために http://togotv.dbcls.jp/movie/100128howCam_f.html の動画を見た後、 実際にArrayExpress < EMBL-EBIというサイトの紹介をしてみようと思い、色々といじっていました。動画の編集はしませんでしたが、…

今日は「ボイスソムリエ」というソフトを使って Primer3 http://togotv.dbcls.jp/20110111.html#p01 というソフトの解説動画を読み上げる音声を作り始めました。「ボイスソムリエ」というソフトは、文章を入力して「読み解析」を押すと、漢字・アルファベッ…

DBCLSでの仕事の内容をつらつらとまとめて書けたらよいなぁという感じです。リアルタイムでの経過はツイッターで。 twitterID:TRYalFarm